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Un 3e cycle unique, ouvert aux étudiants ayant validé le 2e cycle, d’une durée de 3 à 5 ans, est conditionné par le passage des épreuves nationales faisant l’objet d’un classement permettant au candidat de choisir sa discipline et son C.H.U. A terme, les internes obtiennent outre le doctorat d’Etat, un DES qualifiant emportant exercice exclusif de la spécialité considérée. Il peuvent également se voir délivrer un DESC, complément de formation leur reconnaissant une compétence ou une qualification pour certaines spécialités.
L’étudiant en médecine est rémunéré par l’hôpital dès sa 4ème année ; il a alors le statut d’étudiant hospitalier, travaille à mi-temps et reçoit avec sa fiche de paie mensuelle environ 100 € net. Cette sommme double l’année suivante.
Depuis 2004, les étudiants se voient délivrer un diplôme de fin de deuxième cycle, qui permet à son titulaire de se réorienter et d’accéder directement à un niveau D.E.A. ou D.E.S.S.